Apple đã tung ra bản cập nhật sửa chữa các lỗi đầu tiên trên iOS 6 kể từ khi phiên bản này phát hành giữa tháng 9. Mà trước đó một báo cáo từ Boy Genius Report cho rằng Apple đã chuẩn bị tung ra phiên bản iOS 6.0.1 sau khi giai đoạn thử nghiệm sửa lỗi kết thúc. Báo cáo này cũng cho biết, Apple cũng đang làm việc trên một phiên bản đầy đủ tính năng hơn là 6.1 dự kiến sẽ tung ra sau mùa nghỉ lễ.
Phiên bản 6.0.1 được phát hành và cập nhật miễn phí thông qua OTA và iTunes. Phiên bản mới sửa chữa một số lỗi, trong đó có một lỗi gây khó chịu cho người dùng iPhone là việc không thể cài đặt các phần mềm được cập nhật thông qua giao thức OTA (Over The Air). Ngoài ra còn một số lỗi khác như một đường ngang xuất hiện trên bàn phím của iPhone 5, các vấn đề flash của máy ảnh, cải thiện độ tin cậy khi truy cập Wi-Fi và nhiều hơn nữa.
Người dùng có thể cập nhật tự động từ máy thông qua OTA trên máy hay thông qua trình iTunes trên máy tính. Phiên bản mới tương thích và hỗ trợ các thiết bị mới của Apple bao gồm iPhone 3GS trở lên, iPad 2 trở lên và iPod Touch thế hệ thứ 4 trở lên.